神棚がある道場では神前で稽古するのは普通なので、それでは足りないかと思います。
神社の境内で飲み食いしても、その飲食物をお供えしたことにはならないですよね？
私は稽古前に神棚に手を合わせて稽古を捧げる旨宣言するようにしています。
捧げる意思を持つことと、宣言（祈る）することが大事かなと。
他の道場生の手前やりづらい場合は稽古前の黙想の時に心のなかで念じればよいんじゃないでしょうか？
私も良い方法や確証がありませんのでアイデアあれば教えてください！
ところで神道系とは何のことですか？合気道？香取神道流や鹿島神流などの剣術ですか？
