庵野はシン・ウルトラマンはシン・ゴジラとも地続きにある世界観なんだけど版権上は円谷作品と東宝作品を明確に繋げるのは難しいので
シン・ウルトラマンのタイトルロゴの前にシン・ゴジラのタイトルロゴを出したり、シン・ゴジラで首相補佐官の赤坂秀樹役の竹野内豊を
シン・ウルトラマンにも政府側の人間として出演させることで両作品の繋がりを匂わせる程度にとどめたとデザインワークスで説明してる
逆に言えばシン・エヴァはタイトルロゴもシン・エヴァの登場人物も登場しないんだからシン・ウルトラマンとは全く繋がってないって事だ