放浪を続けるシンジ、黒波、アスカにマリやカヲル(復活)が合流して5人は加持の組織に参加。
それにより5人はネルフやヴィレから除名される。
新主人公としていずれも加持の組織に所属する松岡禎丞演じる長身のパイロット(藤田まことがモデル)と逢田梨香子演じる小坊主のパイロット(白木みのるがモデル)が登場して5人(シンジ、黒波、アスカ、マリ、カヲル)と共にネルフやヴィレを倒すストーリーになりそう。
提供は前田製菓(てなもんや三度笠のスポンサー)で映画の冒頭は白黒だが途中からカラーになると予想している。