そもそもシンジが最初にエヴァに乗ったのも、包帯だらけの綾波が痛々しかったから
綾波のために乗るつまり自分の意志で乗ってないってのは最初っからの問題点だった
人類の代表としての自覚なんて元から無かった

だからQでも人類に「乗るな」と言われて、なぜそう言われたのかの説明を受けた上で人類より自分を優先してエヴァに乗った