カードのSuicaをiPhoneに吸い出したらSuica IDが変わるので社内システムに再度登録する必要があると思う。
Suica IDはAWやiPhoneを移動させるとかAW本体入れ替えでも変わるのでそのたび社内システムに再登録じゃない?

運用が面倒だよ。