【1ボードPC】分散コンピューティング【コロナ】
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◆分散コンピューティングについて
一つ一つのPCの処理能力は微力であっても数が集まれば、スーパーコンピューターに匹敵あるいはそれ以上の処理能力となる。
ネットでつながった複数のPCに仕事を分散させて処理させることを分散コンピューティングという。
このスレでは主に、シングルボードPCによる分散コンピューティングについて取り扱っています。
◆BOINCプラットフォームについて
（Berkeley Open Infrastructure for Network Computing プラットフォーム）
分散コンピューティングのためのプラットフォームの一つであり、カリフォルニア大学バークレー校によって開発された。
汎用性が考慮され、このプラットフォーム一つで複数の分散コンピューティングプロジェクトに参加しそれぞれにPCの処理能力を提供できる。
参加者が行うべきことは、第一にBOINCプラットフォームのインストールと、第二に参加したいプロジェクトに対してBOINCを通してログインすることである。
後は自動で、BOINCプラットフォームを通じてこのプロジェクト側からPCに次々タスクが割り当てられ、PCは延々とその処理を行って結果を返す。
BOINCにおいて分散コンピューティングは次のソフトウェアによって実現される。
・「アプリケーション」
分散コンピューティングの各プロジェクトからダウンロードされ、プロジェクトのタスクを含んでいる。
・「コア・クライアント」
各アプリケーションの共通基盤でライブラリのようなものである。
・「GUIやTUIなどの操作用インターフェイス」
「アプリケーション」を除く二つの部分を合わせて、BOINC クライアントと総称する。
Linux, Windows, Mac, Android などで動作する。
【参考】
・Berkeley Open Infrastructure for Network Computing
https://ja.wikipedia.org/wiki/Berkeley_Open_Infrastructure_for_Network_Computing
>>2（BOINCのインストール） 功績が上がったり下がったりしとるｗｗｗｗｗｗｗｗ
不安定だのう_(:3」z)_ telegramが不調で原因調査中
何が悪いんだ
inflaxに取り込んでくれない原因がわからぬ ヒートシンクを大きな物に付け替えたのですが、冷却そのものをナメててすまんかったみたいな感じです。ミルフィーユケースのトップカバーを外しファンはそのまま流用で10度近く下がりました。
総工費280円のお手軽チューン…あ、グリスも買ったから1000円くらいか_(:3ゝ∠)_
_(:3ゝ∠)_
↑ これ「たかざわじゅんすけ」という名前があるんですね telegrafでのタスクを見るのは辞めます
なんか不具合臭いけどgo言語よく知らなんだ
なので一番最後のセクションの[[inputs.file]]の行から下はコメントアウトしてます
>>954
せやで(｀・ω・´)冷却大事やで
実は自分でPC組み立てたことがないんですけど
ヒートシンクの取り付けとか結構新鮮でした
市販のデスクトップマシンはよくみんなの面倒見てたんでなんともないんですけどねー
アクリル式のミルフィーユケースは買っててこれいい作りしてんなーってちょっと嬉しかったっす
説明書捨てたから崩したらもう直せんです(´・ω・｀)
その人の絵って知らずに使ってましたｗｗｗｗｗｗｗｗ >>957
もらえてもrobettaやfoldばっかりですね
私は明日以降に期待し、寝るまでチューニング＆メンテに勤しみますｗ ここから↓
----------------------------------
このスレは、分散コンピューティングプロジェクトRosettaで難病と戦う
我らがチーム「rosetta@raspberrypi.linux.5ch」のホームグランドです。
現在はラスパイなどを武器にコロナと闘っています。
◯チームの稼働状況
https://boinc.bakerlab.org/rosetta/team_display.php?teamid=19963
◯BOINCインストール、プロジェクト＆チームへの参加方法などの基本事項は次のページにまとめてあります。
https://pastebin.com/X0auC92f
◆関連スレ
・【Raspberry Pi】ラズベリー・パイ part54【Arm】
https://mao.5ch.net/test/read.cgi/linux/1583188359/
・【BOINC】余ったPCで分散演算処理【Linux】
https://mao.5ch.net/test/read.cgi/linux/1351064171/
・【Team 2ch】分散コンピューティング総合321【UD→BOINC】
https://matsuri.5ch.net/test/read.cgi/entrance/1587083021/
・Folding@Homeで難病解明 Part9【FAH】
https://medaka.5ch.net/test/read.cgi/pc/1587377692/
---------------------------------------- >>1を立てた者です。次スレ、スレタイ案がございます。（>>959）
１スレ目だけで概要を把握できるようにしましたが、いかがでしょうか。
以下のようにモジュール方式を採用したいと思います。
すなわち、pastebinにおいてノートへのリンクと表題を各々示すようにするわけです。
たとえば、以下では、表題として、「◯チームの稼働状況」「◯参加方法などの基本事項…」を上げています。
もし、追加必要がございましたら、表題とノートのリンク先アドレスを>>1宛にレスお願いします。
異論がなければテンプレに追加したいと存じます。 >>961
どうもありがとうございます。
>>959はチェックしていただいた新リンクに改めたいと思います。 >>962
メンバーの方々が貴重な時間を費やしてまとめて下さった文献、pastebinに追記されると良いと思います。
・ゼロくらいから始めるBOINC
https://github.com/TamamoGozen/ZeroKurai
・telegraf + influxdb + grafana
https://pastebin.com/xAjJh5Qj タスクが枯渇した・・・
いま１CPUしか動いてない・・・ >>965
他のマシン（別アカ）にはいつも通り来てるのに不思議ですね。こちらも間もなく手持ちが無くなりそう…炉端焼すら来なくなっちゃいました。 >>965
この隙にメンテナンスだな
意外と埃たまってるわ。。。 >>940
>>942
完了しましたってメッセージが悪いだけのように思う
登録を受け付けしましただけ表示して
まだ完了していませんって書いておけばバグと言われなかったのにな >>966
誤認でした。他のも新規取得出来なくなていましたorz >>975
RNAと書かれてプロジェクトを追加は出来たけど
ここのラズパイチームは登録してないのね
気長にロゼッタを待つことにします
>>975
いま800万くらいです おちごと終了
>>968
適切な処理が行えてないことを気づけてなかったのかなって思いますねー
色々情報おっかけてたらそれどころじゃなかったようですからね
間に合わないんで辞めます、知りません、ボランティアなので奉仕活動の限界ですって言って逃げても良い案件だったように思いましたね 眠くて思考回路がちゃんとしてない…
この手の話はしないでおこうと思ったのにorz
rosettaたんたまにサイト繋がんないのは4Gの問題なのかなぁ…
iPadからだと繋がるんですけどね(´・ω・｀)おかしいなぁ 2台あるラズパイ4B、すべてRaspberry Pi OS 64bit betaに移行。
最初は2台目(8GB)にだけbetaを入れて動かしていたが、計算中の異常が発生することなく今までずっと動いていたので、1台目(4GB)もbetaに入れ替えた。 16時のレポートによると、仕事キュー0ですね。
全然観察してなかったんだけど、
数ヶ月前の仕事のパイはただ減る一方だったのか、それとも毎日仕事の追加もされていたのか？
こんなことは初めてなのか、ロゼッタプログラムにはこれまでしばしばあったことなのか？
https://boinc.bakerlab.org/rosetta/
As of 23 Jun 2020, 7:01:35 UTC [ Scheduler 稼動中 ]
Total queued jobs: 0
In progress: 456,863
Successes last 24h: 406,211
Users (last day ): 1,359,523 (+33)
Hosts (last day ): 3,286,683 (+4168)
Credits last 24h : 90,388,192
Total credits : 102,873,135,460
TeraFLOPS estimate: 903.882 >>977
Linuxには対応しているが、armには対応してませんね。
folding@homeと仕事を融通しあえる変換の仕組みをロゼッタとつくれば良いのにね。 はじめまして。2週間前から Raspberry Pi 4B を使ったタンパク質の構造解析に参加しています。
それまでWindows10のノートPCででしたが、24h稼働は厳しいので、Raspberry Pi でできるという
書き込みを読み、見よう見まねでチャレンジしています。このスレはかなり参考になりました。
手元の Raspberry Pi 4B (8GB) + Ubuntu 20.04 LTS (64-bit) で実行できたプロジェクトは次の2種類でした。
どちらもCOVID-19関連です。このスレでは Rosetta が人気があるのでしょうか。OpenPandemics も薬剤の
スクリーニングを行っているので面白いかもしれませんね。
- Rosetta@home
- OpenPandemics - COVID19 (World Community Grid) おちごとくだちゃーい_(:3」z)_
>>984
わんわんっ！
>>985
ようこそー >>985
OpenPandemicsも対応してたんですね。
貴重な情報ありがとうございます。 部屋が暑くなって来たので一時休止しようかと思う
お前らすまんな >>987
そうですね。自分の試した範囲では Ubuntu 20.04 LTS (64-bit) で OpenPandemics が動きました。
ただしデフォルトではNGで、次の様な変更を要しました。
問題
World Community Grid (WGC) の OpenPandemics のワークユニットが、
「This project doesn't support computers of type aarch64-unknown-linux-gnu」
エラーのため配信されなかった。
原因
Linux ARM に関する BOINC の Platform の値と、WUが期待する値との間にギャップがあった。
変更方法
Client Configuration File を編集する。
/etc/boinc-client/cc_config.xml : グローバル
~/cc_config.xml : ユーザ毎
</cc_config>の手前に次の5行を挿入し、保存する。
<options>
<no_alt_platform>0</no_alt_platform>
<alt_platform>arm-unknown-linux-gnueabihf</alt_platform>
<allow_remote_gui_rpc>1</allow_remote_gui_rpc>
</options>
それから、WGC のサブプロジェクトで Linux ARM に対応するのは OpenPandemics だけだったので
「マイ・プロジェクト」画面で明示的にやる・やらないを指定した方が良いかもしれません。
また Linux ARM のディストビューションでは、前記の他に次の銘柄で OpenPandemics が動くようです。他にもあるかもしれません。長くてスミマセン
Ubuntu 18.04.4 LTS [4.15.0]
Raspbian GNU/Linux 10 (buster) [4.19, 5.4] >>989
涼しくなった頃に、また一緒にやろうぜ！ 会社から帰ってきたら、仕事が４コア分降ってきてましたが
待機中の課題はありません Raspberry PiでFolding@home (F@h) に参加したいという人にうれしい話で、
ArmマシンにF@hを対応させる動きがあるという記事がありました。
F@hのプロジェクトのディレクターGreg Bowman教授の話として、
『Raspberry Pi や多くの電話で使われているので、将来の方向性になる』ということで
調査のため何人かの人々と連絡を取ってるそう。ぜひ実現させてほしいですね。
Help medical research with folding@home
https://www.raspberrypi.org/blog/help-medical-research-with-foldinghome/ >>990
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